Dự toán thu NSNN năm 2014 Quốc hội giao cho ngành Hải quan là 224.000 tỷ đồng, tăng so với thực hiện năm 2013 (221.930 tỷ đồng) là 9,33% (bình quân mỗi tháng phải thu 18.667 tỷ đồng). Trong đó: Thuế XNK+TTĐB+BVMT: 73.920 tỷ đồng; Thuế GTGT: 150.080 tỷ đồng.Trong bối cảnh kinh tế còn nhiều khó khăn, để hoàn thành nhiệm vụ được giao, Hải quan các cấp đã tiến hành thực hiện nhiều giải pháp đồng bộ, trong đó có các giải pháp về quản lý thu, khai thác nguồn thu, chống thất thu. Kết quả cho thấy ước thu 11 tháng đầu năm đạt khoảng 228.570 tỷ đồng, bằng 102% dự toán được giao.
Theo số liệu trên bảng kê giấy nộp tiền do Kho bạc Nhà nước gửi thì số thu từ ngày 1/11 đến 24/11/2014 đạt 13.548 tỷ đồng; Ước thu 11 tháng năm 2014 đạt khoảng 228.570 tỷ đồng, đạt 102% so với dự toán thu NSNN năm 2014, tăng 14,7% so với cùng kỳ năm 2013 (199.198 tỷ đồng).
Tổng Cục Hải quan đánh giá, nguyên nhân số thu 11 tháng năm 2014 tăng so với cùng kỳ năm 2013: Một số mặt hàng nhập khẩu có kim ngạch lớn, thuế suất cao tăng so với cùng kỳ năm 2013 như: Quặng và khoáng sản khác (tăng 14,5%); Máy móc, thiết bị, dụng cụ, phụ tùng khác (tăng 21,1%); xăng dầu các loại (tăng 13,9%); Sắt thép các loại (tăng 13,7%); Ô tô nguyên chiếc các loại (tăng 100,7%); linh kiện và phụ tùng ô tô (tăng 27,2%); than đá (tăng 44,7%); sản phẩm hóa chất (tăng 16%); chất dẻo nguyên liệu (tăng 11,7%); gỗ và các sản phẩm gỗ (tăng 43,2%)…
Thực hiện chỉ đạo của Bộ Tài chính, trong thời gian qua, toàn hệ thống hải quan tiếp tục đẩy mạnh công tác quản lý thu, khai thác nguồn thu, chống thất thu, qua công tác tham vấn giá, xác định trị giá, xác định mã số tính thuế; Kiểm tra sau thông quan; Tăng cường cơ chế phối hợp liên ngành để ngăn ngừa, kiểm tra, phát hiện các hành vi gian lận thương mại qua xuất xứ hàng hóa, xác định trọng tâm, trọng điểm các mặt hàng có dấu hiệu kim ngạch bất thường, thuế suất cao.
Bên cạnh đó, Tổng Cục cũng chỉ đạo thực hiện tăng cường kiểm tra các trường hợp miễn, giảm, hoàn thuế, không thu thuế, tập trung kiểm tra, hướng dẫn cơ quan hải quan địa phương thực hiện việc quản lý, miễn thuế hàng hóa thuộc dự án ưu đãi đầu tư đảm bảo hàng hóa trong nước đã sản xuất được thì không được miễn thuế theo đúng quy định nhằm bảo hộ sản xuất trong nước.
Tính đến ngày 31/10/2014 toàn hệ thống Hải quan thu hồi được nợ thuế của các tờ khai quá hạn phát sinh từ năm 2013 trở về trước là 1.743 tỷ đồng (Số giao chỉ tiêu thu hồi theo Quyết định 318/QĐ-TCHQ ngày 25/02/2014 và Quyết định 1241/QĐ-TCHQ là 2.811 tỷ đồng), số thu hồi nợ đọng chỉ đạt 62,01%. Số nợ thuế đã được xóa của các DNNN đã giải thể và chuyển đổi cổ phần hoá là 77,5 tỷ đồng.